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miRNA是一类广泛存在于真核生物中的非编码RNA,成熟的miRNA的长度在22nt左右,在转录后水平上通过调节其靶基因行使功能。miRNA已经被证明与多种癌症相关基因的表达有关。因此,识别miRNA的靶基因对于认识基因之间的网络调控关系,以及人类疾病的防治和治疗都有着非常重要的关系。
分析内容:我们可以把分析分成两种类型: 1)预测集:收集多个数据库关系对数据(例如:miRanda、MirTarget2、PicTar、PITA等),使用多个工具预测miRNA-mRNA关系对;2) 验证集:收集实验验证的数据库,输出为经过试验验证的miRNA-mRNA关系对。 提供的内容既可以是?#34892;?#36259;的miRNA,也可以是?#34892;?#36259;的genes. 结果提供关系对数据以及网络图。


图1 miRNA-target网络。A是上调基因的miRNA靶基因网络;B是下调基因的miRNA靶基因网络。

miRNA靶基因分析

miRNA是一类广泛存在于真核生物中的非编码RNA,成熟的miRNA的长度在22nt左右,在转录后水平上通过调节其靶基因行使功能。miRNA已经被证明与多种癌症相关基因的表达有关。因此,识别


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