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转录因子(Transcription factors ,TFs)可以结合在基因上游特异的核苷酸序列上,以此调控基因的表达。基因转录调控网络描述转录因子及其调控的基因之间的关系。理论上,基因调控网络包含所有可能发生的基因调控关系和实现某种生物学功能的不同调控关系的组合机制。通过手工注释和高通量实验获得的基因调控关系使大范围地分析基因调控网络成为可能。但是,哺乳动物的基因调控信息还是远远不够的。基因调控网络也可以用有向图表示,其中点表示转录因子或者被调控的基因,边表示转录因子对基因的调控关系,箭?#20998;?#21521;被调控的基因。
分析内容:提供感兴趣的靶基因列表(一个或者多个),分析调控靶基因的转录因子;或者提供感兴趣的转录因子,分析其调控的靶基因信息。并根据关系对做调控网络图。

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图1.  转录调控网络图。菱形代表转录因子,圆形代表靶基因;边代表调控关系。

转录调网络控分析

转录因子(Transcriptionfactors,TFs)可以结合在基因上游特异的核苷酸序列上,以此调控基因的表达。基因转录调控网络描述转录因子及其调控的基因之间的关系。理论上,基因调控网络


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