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基因与疾病的生存率分析是常见的疾病预后分析之一,生存率分析需要大量的临床样本和临床数据,某些科研工作者可能束手无策!
    云生信团队整合了世界权威公共数据库所有临床样本数据,您只需要提供疾病名称以及感兴趣的基因(或者miRNA,lncRNA)名称,我们会在最快的时间给出疾病基因的生成曲线以及分析报告,全面揭示基因与疾病生存率关系。
分析意义
1.验证基因(或miRNA、lncRNA)的表达高低与疾病生存时间的关系,确定该基因(或miRNA、lncRNA)在疾病的预后中是否起到关键作用。
2.可用于基因表达验证、基因敲出实验、药物处理研究等各种临床分析。
3.可以直接作为文章的结论以及增加文章的影响因子。
参考文?#36164;?#20363;
[IF=4.836] Predictive factors associated with prolonged survival in patients with advanced non-small-cell lung cancer (NSCLC) treated with gefitinib.
[IF=2.862] DDX3X Biomarker Correlates with Poor Survival in Human Gliomas. 
样本数据来源
云生信团队整合了全世界权威公共数据库所有临床样本数据,例如TCGA数据库的34种常见癌症以及超过10000个人类临床样本数据;例如NCBI GEO数据库的2000个实验组以?#30333;?#25968;超过30000个人类临床样本数据。其他还有ICGC、EBI等数据库。
图片可直接使用:
云生信团队的分析过程依托于云生信分析平台(www.biocloudservice.com),获得的分析图片完全达到SCI论文的水平要求,可以直接使用。
分析耗时及报价:
每个基因的分析只需要2000元(原价3000元,限前100名),多个基因同时
分析还有大优惠!




                                     肾上腺皮质癌预后风险microRNA筛选及功能分析
流程:
1. 获得TCGA的肾上腺皮质癌microRNA表达谱数据,标准化
2. 获得TCGA的肾上腺皮质癌的临床数据并进行整理
3. 基于microRNA的表达值对病例分组后利用KM曲线获得对生存预后有显著影响的microRNA
4. 构建COX比例回归模型评估不同microRNA表达值及临床因素筛选对预后有显著影响因素
5. 对关键microRNA的预测调控靶基因及功能分析
6. 构建microRNA共调控靶基因网络并对共调控靶基因进行功能分析
关键词: TCGA; 肾上腺皮质癌;COX回归;KM曲线;预后;microRNA
结果和结论
1. 生存分析结果
基于microRNA的均值对病例的分组生存分析我们获得了**个对生存曲线影响显著的microRNA。**个KM曲线分析指示:**个microRNA低表达的情况下患者的生存时间显著高于高表达的情况。?#24471;?#36825;些microRNA有可能抑制了某些癌症的关键基因,导致机体功能紊乱从而导致生存时间的显著降低。






               图1: miRNA与疾病的生存曲线(部分结果举例)
                                                                         
2. COX比例回归分析
我们对这**个基因利用表达值进行COX比例回归分析,获得每个microRNA对预后的风险比。**。
表1. COX比例回归分析结果

factor β HR p-value lower 95% upper 95% 
hsa-mir-*** 0.2034 1.226 0.00144 1.0815 1.389
hsa-mir-**** 0.277 1.319 0.002321 1.1038 1.577
hsa-mir-*** 3.007 20.23 0.0000551 4.691 87.23
hsa-mir-** 0.3116 1.366 0.004455 1.1017 1.693
hsa-mir-*** 12.32 224800 0.001461 113.6558 444500000
3. 风险microRNA调控网络
根据COX比例回归分析,我们获得了 **个对肾上腺皮质癌预后有显著影响的microRNA,?#20197;?#20182;们高表达的条件下,病人预后较差。miRWalk工具预测到的microRNA调控靶基因

图2. 风险microRNA的调控靶基因网络

4. microRNA调控靶基因功能?#24739;?#20998;析


图3. miRNA的功能?#24739;?#20998;析结果
5. 共调控的靶基因功能分析

图4. 风险microRNA的共调控靶基因网络

疾病生存率分析

基因与疾病的生存率分析是常见的疾病预后分析之一,生存率分析需要大量的临床样本和临床数据,某些科研工作者可能束手无策! 云生信团队整合了世界权威公共数据库所有临床样本


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